2025年六期论文精选丨scRNA-seq解析胶质母细胞瘤肿瘤微环境的关键预后组分
scRNA-seq解析胶质母细胞瘤肿瘤微环境的关键预后组分
陈瑶1，2，姜宇慧1，隋轶3，王立辉1*
(1.沈阳药科大学临床药学院 药理教研室，辽宁 沈阳 110016；2.沈阳市第一人民医院 神经内科，辽宁 沈阳 110041；3.沈阳市第四人民医院 神经内科，辽宁 沈阳 110031)
作者简介：陈瑶，女，主任护师。研究方向：神经肿瘤。
*通讯作者：王立辉，教授，邮箱：wlhcw@163.com。
摘要：目的 利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)解析复发性胶质母细胞瘤(GBM)中肿瘤微环境的关键组分及其与患者预后的关系。方法 从GEO、TCGA和CGGA数据库中获取GBM患者的RNA测序表达数据和临床数据。使用R语言中Seurat、Harmony、FindVariableFeatures、FindNeighbors、FindClusters和CellTypist等分析包对细胞进行聚类分析，利用UMAP分析并可视化不同标记基因在细胞中的差异表达。CellChat评估细胞间相互作用。单因素COX回归分析和Kaplan-Meier分析进行相关细胞和基因的生存分析。利用高维加权基因共表达网络分析关键基因模块，并利用GO和KEGG进行富集分析。LASSO进行关键基因的筛选验证。结果 复发组胶质母细胞瘤中NaïveCD4和CytotoxicCD8细胞比例明显高于原发组。NaïveCD4细胞可能通过TNF信号通路与Glioma细胞相互作用。经过筛选得到关键枢纽基因IGFBP5和RGS16，并验证得到两者在预后中具有有效价值。结论 NaïveCD4细胞是复发性胶质母细胞瘤肿瘤微环境的关键预后组分；且IGFBP5和RGS16基因可能是潜在的治疗靶点。
关键词：胶质母细胞瘤；单细胞RNA测序；肿瘤微环境；NaïveCD4细胞
中图分类号：R730.2 文献标志码：A DOI：10.12385/j.issn.2096-1278(2025)06-0001-11
本文原载于《临床研究》2025年第6期1-11页
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